Ngày 14/5/2019, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã triệt phá đường dây tội phạm có tổ chức do Bùi Quang Huy (SN 1974, TGĐ công ty Nhật Cường, trú tại Thụy Khê, Hà Nội) chủ mưu cầm đầu. Lực lượng chức năng tiến hành khởi tố với Bùi Quang Huy, tuy nhiên Bùi Quang Huy đã bỏ trốn và cơ quan chức năng phải ra lệnh truy nã.
Trong khi Bùi Quang Huy bỏ trốn thì 8 đồng phạm của Huy là: Nguyễn Thị Bích Hằng, Nguyễn Bảo Ngọc, Trần Ngọc Minh, Đỗ Quốc Huy, Hoàng Văn Phong, Nông Văn Lủ, Đỗ Văn Dũng, Ngô Văn Sử đã bị khởi tố, bắt tạm giam. Đây là những lãnh đạo chủ chốt, có vai trò quan trọng tại Công ty Nhật Cường.
Liên quan những gói thầu ưu đãi "bất thường" cho Nhật Cường, ngày 28/11/2019 lực lượng chức năng khởi tố thêm các bị can: Nguyễn Tiến Học, nguyên Phó Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư thành phố Hà Nội; Phạm Thị Kim Tuyến, Trưởng phòng Đăng ký kinh doanh Sở Kế hoạch và Đầu tư thành phố Hà Nội; Lê Duy Tuấn, Giám đốc kinh doanh Công ty Trách nhiệm hữu hạn Đầu tư và phát triển Đông Kinh. Các bị can bị khởi tố để điều tra về hành vi “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”.
Mở rộng điều tra, Cơ quan Cảnh sát Điều tra Bộ Công an khởi tố, bắt tạm giam hai bị can: Nguyễn Văn Tứ, Chánh Văn phòng Thành ủy Hà Nội và bị can Phạm Thị Thu Hường, Chánh Văn phòng Sở Kế hoạch và Đầu tư thành phố Hà Nội.
Ngày 21/01/2020, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã ra các Quyết định khởi tố bị can, Lệnh khám xét và Lệnh bắt tạm giam 3 bị can, gồm: Phạm Văn Hiệp, Nguyễn Bảo Trung, Mai Tiến Dũng, Trưởng ngành hàng điện thoại cũ Công ty Nhật Cường; Quyết định khởi tố bị can, Quyết định truy nã bị can đối với Đỗ Văn Hùng về tội Buôn lậu.
Ngày 10/7/2020, Cục Cảnh sát điều tra tội phạm về tham nhũng, kinh tế, buôn lậu, Bộ Công an đã ra quyết định khởi tố bị can, lệnh khám xét nhà, bắt tạm giam với Bùi Quốc Việt (trú tại Hoàn Kiếm, Hà Nội). Ông Bùi Quốc Việt là anh trai của bị can Bùi Quang Huy (ông chủ chuỗi Nhật Cường Mobile, hiện đang bị truy nã). Đồng thời lực lượng chức năng tiến hành khởi tố với ông Võ Việt Hùng (trú tại Bắc Từ Liêm, Hà Nội, Giám đốc Công ty TNHH Đầu tư và phát triển Đông Kinh).
Mới đây nhất, ngày 22/7/2020, Cơ quan Cảnh sát Điều tra tiến hành khởi tố, bắt tạm giam 3 bị can: Nguyễn Anh Ngọc (SN 1974, trú tại phường Bồ Đề, quận Long Biên, Phó trưởng Phòng Thư ký biên tập, Tổ giúp việc của Ủy ban nhân dân TP Hà Nội); Nguyễn Hoàng Trung (SN 1983, trú tại phường Bạch Đằng, quận Hai Bà Trưng, Hà Nội, là lái xe của Chủ tịch UBND TP Hà Nội); Phạm Quang Dũng (SN 1983, trú tại xã Tân Triều, huyện Thanh Trì, Hà Nội, nguyên cán bộ của Cục Cảnh sát điều tra tội phạm về tham nhũng, kinh tế, buôn lậu (C03), Bộ Công an.