Theo quan sát, bãi giữ xe ở 2 tầng hầm trong Bến xe Miền Đông mới rộng rãi, thông thoáng. Tuy nhiên, nơi đây lại khá vắng vẻ, thậm chí người dân còn vô tư nằm ngủ ngay khu vực cạnh hầm giữ xe.
Quang cảnh ảm đảm, vắng tanh tại khu vực thang cuốn ở Bến xe Miền Đông mới - bến xe hiện đại nhất Việt Nam.
Tại khu vực quầy bán vé được thiết kế hiện đại, đẹp mắt nhưng rất vắng vẻ.
Gần như không có hành khách ngồi chờ xe để xuất bến.
Thậm chí có trường hợp đơn vị vận tải có phương án ngừng hoạt động tuyến cố định liên tỉnh, chuyển sang hoạt động xe hợp đồng. Với việc đón hành khách gần trung tâm thành phố, lợi thế của các đơn vị vận tải này đã gây nhiều khó khăn cho các đơn vị vận tải hoạt động tại bến. "Hành khách không có thói quen đến bến để sử dụng dịch vụ, các đơn vị vận tải vào bến không có hành khách, từ đó các đơn vị vận tải đang chấp hành tốt tìm phương án để tồn tại và vi phạm tương tự các đơn vị đang vi phạm", đại diện Bến xe Miền Đông mới nói.